今钟山境域夏朝时期,属梁州荒裔;殷商时期,属鬼方地;周朝时期,属雍州荒裔;秦朝时期,属夜郞国地;汉朝时期,属益州部牂牁郡地;蜀汉时期,属牂牁属国罗甸地;晋朝时期,属宁州所领牂牁郡地;宋齐时期,属宁州平蛮郡地;梁隋时期,属㸑蛮卢鹿部地、牂州、牂牁郡等;唐朝时期,属罗甸国地,隶黔中道;宋朝时期,属罗甸部罗氏鬼国;元朝时期,属罗甸部罗氏鬼国、顺元路宣抚司、顺元路宣慰司等;明朝时期,属贵州宣抚司、贵州宣慰司,隶贵州布政司;清朝时期,属大定府、水城厅。
雍正十一年(1733年),设水城厅,划大定府永顺里、常平里归水城厅管辖(现钟山境域大部属永顺里、常平里)。
民国二年(1913年)1月,水城厅改为水城县,属贵西道水城县。
民国十二年(1923年),属贵州省水城县。
1950年水城县解放后属毕节水城县。
1966年属毕节水城县和贵州省水城特区。
1970年12月,设六盘水地区后属六盘水地区水城特区。
1978年12月,设六盘水市后属六盘水市水城特区。
1987年12月15日,《国务院关于贵州省撤销水城特区设立六盘水市钟山区和水城县批复》(国函〔1987〕199号),批准设六盘水市钟山区和水城县。
1987年12月,国务院以国函[1987]199号文件批复:撤销水城特区,设立六盘水市钟山区和水城县;以原水城特区的水城、大河、汪家寨、大湾、老鹰山、观音山6个镇和城关、教场、其林、德坞、凤凰、白腻、月照、煤厂、以德、艺奇、纳福、三合、二塘13个乡为钟山区的行政区。因市中心有上钟山、下钟山而得名。
1996年,钟山区辖2个街道6镇1乡1个民族乡:黄土坡街道、荷城街道、德坞镇、大湾镇、汪家寨镇、大河镇、老鹰山镇、观音山镇、凤凰乡、月照彝族回族苗族乡。区政府驻威水路。
200年第五次人口普查,钟山区总人口453293人,其中:黄土坡街道125533人,荷城街道91632人,凤凰街道32221人,德坞街道12052人,老鹰山镇33181人,观音山镇9716人,大河镇32486人,汪家寨镇52957人,大湾镇48267人,月照彝族回族苗族乡15248人。
2000年末,钟山区辖黄土坡、荷城、凤凰、德坞4个街道,大湾、汪家寨、大河、老鹰山、观音山5个镇和月照彝族回族苗族,共有67个行政村、65个居委会。
2003年末,钟山区总人口42.70万人,其中非农业人口25.20万人,占总人口的59.02%;少数民族人口7.9万人,占18.50%。辖4个街道、4个镇、1个民族乡:黄土坡街道、荷城街道、凤凰街道、德坞街道、老鹰山镇、大河镇、汪家寨镇、大湾镇、月照彝族回族苗族乡。共有49个城市社区,21个居委会,53个村委会。
2007年末,全区总面积478.84平方千米,总人口45.91万人,其中少数民族8.4万人,非农业人口30.29万人,辖4个街道、4个镇、1个民族乡,50个社区、19个居委会、53个行政村。
2010年末,常住人口61.76万人。2011年末,钟山区面积478平方千米,常住人口61.88万人,户籍人口49.73万人,辖4个街道、4个镇、1个民族乡。
2013年5月21日,贵州省政府批复同意将钟山区老鹰山镇整建制划归水城县管辖(黔府函[2013]105号),将水城县双戛彝族乡整建制划归钟山区管辖(黔府函[2013]106号),老鹰山镇、双戛彝族乡行政区域和政府驻地不变,钟山区、水城县行政区域界线做相应变更。调整后,钟山区辖4个街道、3个镇、2个民族乡:黄土坡街道、荷城街道、凤凰街道、德坞街道、大河镇、汪家寨镇、大湾镇、月照彝族回族苗族乡、双戛彝族乡。