历史沿革
万山，古称大万山，以山得名。今特区辖境，自古以来行政区划多变，隶属关系复杂。夏商为荆州之域，周朝时属楚，秦朝时属黔中郡，汉朝时属武陵郡，魏晋南北朝初属武陵郡，后属东牂牁郡，隋朝时属辰州，唐朝时属锦州，宋朝时属沅州。元至六十四年（1277年），置大万山苏葛办等处军民长官司，黄道溪野鸡坪蛮夷长官司，均属于思州安抚司。明朝洪武初，万山、黄道、施溪等3个土司隶属关系沿元未变。洪武五年六月十三日（1372年7月13日），大万山司随思州宣慰司改属湖广行省；施溪漾头司迁治平地寨，改称施溪长官司，隶属湖广沅州卫，洪武六年（1373年），又改属于思州慰司。洪武二十五年（1392年），以务程龙鳌、坪岳溪、都坪等蛮夷长官司并入黄道溪长官司，迁治武陵坪（今黄道侗族乡街上平溪寨），仍隶属思州宣尉司。后思州宣尉使田琛与思南宣尉使田宗鼎争砂坑有怨，举兵相攻，琛称天主，朝廷敕镇远侯顾成以兵弹压。事平，革除思州、思南二宣尉司，设贵州布政使司。以思州宣尉司地置思州、黎平、新化、石阡4府，以思南宣尉司地置思南、铜仁、乌罗、镇远4府，上述8府均隶属贵州布政使司。永乐十二年三月二日（1414年3月22日），大万山长官司划属铜仁府管辖，黄道溪长官司，施溪长官司划属思州府管辖。
清朝实行“土改归流”的政策，自雍正以后，土司大部分被裁撤，大万山长官司由铜仁府派流官直接管理黄道溪长官司和施溪长官司由思州府派流官直接管理。光绪六年八月二十六日（1880年）贵州巡抚岑毓英奏准，将铜仁县移治江口，而将省溪司（今江口县）流官吏目改驻大万山，于是大万山又名省溪，治万山城内（今解放街），仍隶属铜仁府。
中华民国2年8月（1913年），设置省溪县。省溪县成立初隶属贵州省黔东道（又名镇远道）。民国12年（1923年），废黔东道，省溪县直隶于贵州省政府。
民国24年元月（1935年），省溪县隶属第九行政督察区，专员公署驻铜仁。民国26年11月（1936年），铜仁改称第六、七两个行政督察区合并成立新的第一行政督察区，专员公署驻镇远，省溪县隶属第一行政督察区。民国30年（1941年），撤销省溪县，其辖地并入玉屏县和铜仁县。
1949年解放，属玉屏县第六区。1958年12月划属铜仁县，建万山公社。1961年8月，又划属玉屏县恢复万山区。1966年2月22日，经国务院批准，设立万山特区隶属铜仁地区。1968年9月24日，贵州省革命委员会批准，撤销万山特区，建立万山镇，直属铜仁地区。1970年8月8日，国务院批准，恢复万山特区。仍属铜仁地区。
2011年11月，国务院批复同意撤销铜仁地区设立地级铜仁市，设立万山区。
设立情况
2011年1月5日，根据《贵州省政府关于同意将铜仁市谢桥街道行政区域划归万山特区管辖的批复》精神，将铜仁市谢桥街道的谢桥、唐家寨、楚溪、龙门坳、石竹、瓦屋坪6个村和谢桥社区居委会划归万山特区管辖；谢桥街道大坳村划归铜仁市环北街道管辖。2011年2月28日起，谢桥划转区的管辖权由铜仁市正式移交万山特区。据悉，万山特区党政机关将搬迁到位于谢桥的铜仁市为民服务中心里，而铜仁市党政机关将搬迁到铜仁市川硐镇凉湾行政区。
2011年，《国务院关于同意贵州省撤销铜仁地区设立地级铜仁市的批复》（国函[2011]131号）：
一、同意撤销铜仁地区和县级铜仁市、万山特区，设立地级铜仁市，市人民政府驻新设立的碧江区花果山中路20号。
二、铜仁市设立碧江区。以原县级铜仁市（不含茶店镇、鱼塘乡、大坪乡）的行政区域为碧江区的行政区域。区人民政府驻市中街道环西路93号。
三、铜仁市设立万山区。以原万山特区和原县级铜仁市的茶店镇、鱼塘乡、大坪乡的行政区域为万山区的行政区域。区人民政府驻万山镇。
四、铜仁市辖江口县、石阡县、思南县、德江县、玉屏侗族自治县、印江土家族苗族自治县、沿河土家族自治县、松桃苗族自治县和新设立的碧江区、万山区。
