修文历史悠久，春秋时期属牂牁地，唐朝时期分属功州和蛮州。元世祖至元二十年(1283)，四川行省讨平九溪十八洞后置顺元等路军民安抚司，立总管府，听顺元路宣慰司节制。安抚司领贵州等处长官司24个，其中置于息烽县和修文县地的有青山远地等处、底寨等处、落邦扎佐等处和六广等处4个蛮夷长官司，隶四川行省。二十九年改隶湖广行省。
明洪武五年(1372)，县地蛮夷长官司长官内附，改置为青山长官司、底寨长官司和扎佐长官司，复隶四川行省；同时，裁六广等处蛮夷长官司，将其地归入贵州宣慰使霭翠亲领水西地，属于的则溪地属的龙尔(今龙场)、底飞(今六广)2目。明洪武十七年（1375），贵州宣慰使奢香开龙场九驿，其中坐落在今县境的有龙场驿和六广驿。永乐十一年(1413)置贵州行省，县境各长官司即属贵州节制。
崇祯三年(1630)置敷勇卫。以贵州宣慰司安氏亲领之龙尔地置卫城和卫直辖地，卫指挥使司设其间；以底飞地置濯灵守御千户所，治地六广城；废扎佐长官司，以其地置修文守御千户所，治地扎佐城；废青山长官司，以其地置于襄守御千户所，治地九庄城；以贵州前卫故绝六屯地及底寨长官司部分地置息烽守御千户所，治地息烽城。底寨长官司和底寨副长官司继续保留。
清康熙二十六年(1687)，裁敷勇卫置修文县，隶属贵阳府。改卫城为县城。将全县划为至孝、崇义、信顺和仁和4个里，下辖32甲、207个村寨。置县之后，仍保留底寨正、副长官司，至道光年间裁废，辖地划归仁和里。光绪三十一年(1905)，贵阳府将瓯脱地养龙司5个保和麦西里属地安马庄拨归修文县管辖。
民国3年(1914)8月，经内务部呈大总统核准，划修文县仁和里全境、信顺里5个甲和崇义里3个甲，以及贵阳、紫江(今开阳)部分地置息烽县。4年(1915)，由息烽、修文和贵阳等县知事实地踏勘划定县界。县界基本固定，隶属黔中道，全县划分为7区、47保、235个甲，共有524个村寨。民国9年，裁黔中道，隶属贵州省。民国21年，区以下废保置乡(镇)，全县建10个镇和60个乡。区改以序号名区，即中南区为第一区，中北区为第二区，东区为第三区，南区为第四区，西区为第五区，北一区为第六区，北二区为第七区。
民国24年(1935)，废乡(镇)，置联保，县改隶贵州省第一行政督察区。26年，县隶省直辖区。27年调整区划，全县调为6个区，将第一区改为直辖区，第二区改为第一区，第五区改为第二区，第三区和第四区不变，第六区、第七区合并为第五区。区下置25个联保，联保下置133个保。民国30年，县复直隶省。31年推行新县制，撤销区和联保复置乡(镇)，下辖保、甲。自此，全县行政区划共划为2个镇和11个乡、126个保、1069个甲。至38年(1949)9月，全县计有13个乡(镇)126个保，1053个甲。
1949年11月17日，修文县解放。11月24日，建立县人民政府，全县置乌栗、扎佐、石安和六广4个区，辖13个乡(镇)，县隶属贵阳专区。次年4月，乌栗区政府迁驻县城，改称城关区。8月按序号名区，城关区改称第一区，扎佐区改称第二区，石安区改称第三区，六广区改称第四区。1952年4月，第三区迁驻久长，并于小箐增设第四区，改第四区为第五区。缩小乡的规模，将全县调为5个区，辖2个镇和31个乡。11月19日，县改隶贵定专区。
1955年11月，复按地名称区，即第一区称城关区，第二区称扎佐区，第三区称久长区，第四区称小箐区，第五区称六广区。1956年2月，全县划为2个镇和46个乡。4月18日县改隶安顺专区。是年6月，裁撤小箐区，所辖各乡纳入久长区。8月，全县划为4个区，辖2个镇、28个乡建制。1957年7月，城关镇和扎佐镇升格为区级镇，全县划为4个区和2个镇、28个乡。
1958年9月，大办人民公社，取消区、乡建制，全县建“政社合一”的人民公社9个，12月改建为8个人民公社，辖29个管理区。管理区下置176个生产队、897个生产小队。是年12月29日，县改隶贵阳市。1961年6月，贯彻中共中央调整方针，恢复区的建置，改管理区为公社，生产队改称生产大队，生产小队改称生产队。全县复置5个区，区以下置30个公社、230个生产大队、1321个生产队。
1962年4月，撤销久长、小箐两区，将原久长区的石安公社和马官公社并入阳明公社后划属城关区，金桥、清水公社并入久长公社后隶属扎佐区；将原小箐区的崇恩公社划属城关区，洒坪并入小箐公社后，连同马场、中寨公社划属六广区；将城关区的新场公社并入谷堡公社，增置水塘公社隶城关区；将三元公社并入扎佐公社仍属扎佐区；将六广区的红岩并入大石公社和花榔、凉井、宝寨并入六桶公社后仍归六广区。全县共有3个区21个公社。公社下置229个生产大队、1353个生产队。是年10月，恢复城关镇建制。1963年3月，扎佐公社析为扎佐镇和高潮公社，全县调为5个区，辖2个镇和29个公社、226个大队、1339个生产队。6月，城关区增加新场公社；10月，六广区增加红岩公社。21日县改隶安顺专区。至1965年11月，全县共有5个区，辖2个镇和31个公社、228个生产大队、1356个生产队。
1966年5月进行撤区试点，裁久长区，将原区属久长、金桥、清水3个公社合并为久长公社，直隶于县；将石安公社划属城关区辖；将马官公社和水塘公社的程官、青龙2个大队并入阳明公社后改称马家桥公社；并将水塘公社之水塘大队划属三元公社；高仓、小山、水竹和罗家寨大队划属王官公社；将扎佐镇、高潮公社和三元公社之磨盘寨生产队合并为扎佐公社。全县为4个区，辖1个镇和27个公社(含久长直属公社)、206个大队、1110个生产队。
1981年1月，撤久长直属公社复置久长区，由扎佐公社析出扎佐集镇部分恢复扎佐镇建制，全县调为5个区，辖2个镇、30个公社、215个大队、1739个生产队。至1983年，大队增为217个，生产队减为1668个，并有12个居民委员会。
1984年4月，取消公社建制，实行政、社分设，复建乡(镇)、村政权，乡(镇)辖村民委员会(居民委员会)，村以下建村民小组。全县共建立5个区，辖2个镇和30个乡、217个村民委员会和12个居民委员会、1403个村民小组。5月，城关镇升格为区级镇。6月，改桃源乡、大石乡为大石布依族乡。1985年9月，将久长乡改为久长镇，六广乡改为六广镇。至1990年，全县共建5个区和1个区级镇，辖28个乡(其中布依族乡2个)和3个乡级镇、217个村民委员会和12个居民委员会、1434个村民小组。1513个自然村寨。
1992年2月，将全县5区32乡(镇)撤并为城关、扎佐、久长、六广4个镇和谷堡、六屯、小箐、洒坪、大石、六桶6个乡，以体现“小政府，大服务”的特点。1996年1月，修文县划归贵阳市管辖。1999年9月，城关镇更名为龙场镇。2003年10月，全县撤居民段改置社区，龙场置龙岗、栖凤、宾阳、虎山4个社区；六广、小箐、久长镇分别将原来的居委会改为社区；扎佐镇原2个居委会改建为景阳和襄阳2个社区，2005年8月增设万江社区。
2011年7月，龙岗社区服务中心挂牌成立。2012年8月修文县珍珠河社区服务中心启动。
2013年，修文县开展撤乡设镇工作，六屯乡、六桶乡、洒坪乡改为六屯镇、六桶镇、洒坪镇，全县共有10乡(镇)，113个行政村、12个居委会，1322个村民组。修文县下设2个社区服务中心，分别为龙岗社区服务中心、珍珠河社区服务中心。2016年11月，龙场镇城南村、城北村分别改为翠屏居委会、中山居委会，扎佐镇红桥村改为红桥居委会，改属珍珠河社区，新园村改为新园居委会，改属珍珠河社区，久长镇久长村改为青龙居委会，全县辖108个行政村17个居委会。
2017年7月，撤销谷堡乡、小箐乡设立谷堡镇、小箐镇。
2019年6月，龙岗社区服务中心在易地扶贫搬迁安置点成立龙潭居委会。
2020年5月，省人民政府批复同意撤销龙场镇、扎佐镇、久长镇、龙岗社区、珍珠河社区，设立龙场、阳明洞、扎佐、景阳、久长街道。
目前，全县辖龙场、阳明洞、扎佐、景阳、久长5个街道，六广、六屯、洒坪、六桶、谷堡、小箐镇和大石布依族乡7个乡镇，108个行政村，18个居委会，1253个村民小组，126个居民小组。
