1987年12月，国务院以国函[1987]199号文件批复：撤销水城特区，设立六盘水市钟山区和水城县；以原水城特区的水城、大河、汪家寨、大湾、老鹰山、观音山6个镇和城关、教场、其林、德坞、凤凰、白腻、月照、煤厂、以德、艺奇、纳福、三合、二塘13个乡为钟山区的行政区。因市中心有上钟山、下钟山而得名。
1996年，钟山区辖2个街道6镇1乡1个民族乡：黄土坡街道、荷城街道、德坞镇、大湾镇、汪家寨镇、大河镇、老鹰山镇、观音山镇、凤凰乡、月照彝族回族苗族乡。区政府驻威水路。
200年第五次人口普查，钟山区总人口453293人，其中：黄土坡街道125533人，荷城街道91632人，凤凰街道32221人，德坞街道12052人，老鹰山镇33181人，观音山镇9716人，大河镇32486人，汪家寨镇52957人，大湾镇48267人，月照彝族回族苗族乡15248人。
2000年末，钟山区辖黄土坡、荷城、凤凰、德坞4个街道，大湾、汪家寨、大河、老鹰山、观音山5个镇和月照彝族回族苗族，共有67个行政村、65个居委会。
2003年末，钟山区总人口42.70万人，其中非农业人口25.20万人，占总人口的59.02%；少数民族人口7.9万人，占18.50%。辖4个街道、4个镇、1个民族乡：黄土坡街道、荷城街道、凤凰街道、德坞街道、老鹰山镇、大河镇、汪家寨镇、大湾镇、月照彝族回族苗族乡。共有49个城市社区，21个居委会，53个村委会。
2007年末，全区总面积478.84平方千米，总人口45.91万人，其中少数民族8.4万人，非农业人口30.29万人，辖4个街道、4个镇、1个民族乡，50个社区、19个居委会、53个行政村。
2010年末，常住人口61.76万人。2011年末，钟山区面积478平方千米，常住人口61.88万人，户籍人口49.73万人，辖4个街道、4个镇、1个民族乡。
2013年5月21日，贵州省政府批复同意将钟山区老鹰山镇整建制划归水城县管辖（黔府函[2013]105号），将水城县双戛彝族乡整建制划归钟山区管辖（黔府函[2013]106号），老鹰山镇、双戛彝族乡行政区域和政府驻地不变，钟山区、水城县行政区域界线做相应变更。调整后，钟山区辖4个街道、3个镇、2个民族乡：黄土坡街道、荷城街道、凤凰街道、德坞街道、大河镇、汪家寨镇、大湾镇、月照彝族回族苗族乡、双戛彝族乡。
