镇宁档案馆成立于1959年4月20日，建馆初期，在县委、县人民政府的大力领导下，在各部门的大力支持下，根据国家统一管理档案的原则，接收了部分档案进馆，为开展档案工作奠定了基础。

1966年5月，“文化大革命”开始，全县档案工作被迫中断，档案工作机构被撤销，人员被调离，业务工作被停顿。十年“文化大革命”结束后，1977年镇宁自治县档案馆又恢复建立，全县档案工作又回到了正轨。

1982年7月22日，根据上级有关文件精神，成立了镇宁自治县档案局，与档案馆合署办公，实行一套人员两块牌子体制，是全县政治、经济、文化和科学、历史研究等社会活动利用档案的基地。档案馆于一九八八年破土动工，一九九一年十二月十七日建成正式投入使用，占地2.32亩，总建筑面积1300平方米。