贵州省黔东南自治州水文水资源局内设办公室、组织人事科、站网测验科、水情水资源评价科和水环境监测科；下辖锦屏水文监测站、施洞水文监测站、下司水文监测站、湾水水文监测站、六洞桥水文监测站、南花水文监测站、旧州水文监测站、施秉水位监测站、大菜园水文监测站、岑巩水文监测站、石灰厂水文监测站和寨蒿水文监测站；71个雨量站；8个水质监测站；8个水土保持监测站。

机构职能

负责黔东南州水文水资源系统的行政和业务技术管理，经办全州水文水资源调查分析工作；负责全州国家水文基本站网、防汛抗旱水情信息和水质预警报系统的具体规划、建设和管理；组织进行全州水资源调查具体分析，承担全州水资源简报的编制以及城市防洪预案的编制工作；负责全州水文情报预报工作，向各级人民政府和防汛抗旱指挥机构提供水文情报预报信息；参与编制全州水资源公报工作；负责全州江河、重要水源、水库重要城镇河段，重要排入河口的水质取样和突发性水污染河段的监测，适时提出监测河流河段、水库等的水质分析报告；承办省水文水资源局、黔东南州人民政府临时交办的其它水文水资源业务工作。